Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2AP24928 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms