Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COX6A1P12074 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms