Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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