Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GOPCQ9HD26 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms