Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FSCN1Q16658 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms