Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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ECM1Q16610 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ECM1Q16610 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ECM1Q16610 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ECM1Q16610 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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ECM1Q16610 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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ECM1Q16610 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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