Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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