Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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COL4A6Q14031 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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COL4A6Q14031 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
COL4A6Q14031 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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