Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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