Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PRPF4BQ13523 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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