Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SP140Q13342 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SP140Q13342 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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