Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ACACAQ13085 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms