Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms