Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms