Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRZ1P23471 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRZ1P23471 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms