Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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