Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
VPS45Q9NRW7 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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