Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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