Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD42Q8N9B4 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms