Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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