Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms