Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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