Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SSPNQ14714 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms