Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RUNX3Q13761 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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RUNX3Q13761 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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RUNX3Q13761 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RUNX3Q13761 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RUNX3Q13761 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RUNX3Q13761 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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