Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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