Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CACNA1SQ13698 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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