Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms