Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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