Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NME3Q13232 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms