Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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