Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPREP23469 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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