Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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