Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms