Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms