Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 FLT1-206ENST00000615611 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TRAV20-201ENST00000390448 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.6-201ENST00000391156 130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC131097.2-201ENST00000404031 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP63-201ENST00000405405 1007 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01687-202ENST00000419467 465 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 BMF-203ENST00000431415 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC007557.2-201ENST00000440900 583 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC018638.2-201ENST00000471258 403 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC02016-201ENST00000488425 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL023284.4-201ENST00000564248 374 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC233702.11-201ENST00000598588 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00635-210ENST00000600240 714 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF678-205ENST00000608949 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PPARGC1A-216ENST00000612355 936 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PPARGC1A-218ENST00000617484 1026 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 C1orf137-201ENST00000624685 386 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MAGOHB-211ENST00000625272 319 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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