Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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