Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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CUL3Q13618 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CUL3Q13618 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL3Q13618 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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