Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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