Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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