Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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