Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms