Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms