Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms