Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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