Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms