Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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