Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms