Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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