Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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