Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTPAP49638 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TTPAP49638 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TTPAP49638 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TTPAP49638 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TTPAP49638 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms